新加坡国立大学刘博翔课题组招聘博士后(基因组/生物信息学方向)

新加坡国立大学(NUS)刘博翔课题组招收博士后(Postdoctoral Research Fellow)。新加坡国立大学世界排名第11,亚洲排名第一(QS world university rankings 2022)。课题组专注于基因组学计算方法的开发,以及基因组学大数据挖掘。

1、PI简介

刘博翔,博士生导师。伊利诺伊卫斯理大学获得生物物理学士,斯坦福大学统计学硕士,斯坦福大学生物信息学博士。博士期间以第一作者身份在Nature Genetics,American Journal of Human Genetics等杂志发表多篇文章,并获得CEHG fellowship以及Charles B Carrington Memorial Award。毕业后入职百度美国硅谷研究院,担任资深研究员,并于2021年升为主任研究员,领导机器学习+基因组学的研究工作。在研究院期间申请美国专利两项,发表Nature以及PNAS等多篇文章,所在团队入围百度最高奖。2022年加入新加坡国立大学。团队目前已在Nature,Nature Genetics,Nature Medicine,Nature Communications, Genome Biology,American Journal of Human Genetics等期刊以第一作者,通讯作者,或共同作者发表文章40余篇,共被引用6000余次。应邀担任Cell Genomics, American Journal of Human Genetics, Briefings in Bioinformatics等杂志审稿人,并担任Frontiers in Artificial Intelligence副编辑。

课题组主页:http://www.boxiangliulab.com/

CV: https://tinyurl.com/6zrra5k9

联系方式:boxiangliu@nus.edu.sg

2、研究方向

课题组致力于开发了基因组学计算工具,以及基因组学的大数据挖掘。具体方向如下:

1.  Single-cell multi-omic quantitative trait loci: We seek to identify cell-type-specific regulation of molecular traits using single-cell multi-omic measurements from multiple tissues (e.g. blood, adipose, kidney, liver). Our group works on autoimmune, cardiovascular, and metabolic diseases (e.g. T2D). Our group has access to several unique multi-ethnic cohorts with sample sizes ranging from hundreds to thousands of donors. Our lab is part of the Asian Immune Diversity Atlas (AIDA), Genotype-Tissue Expression project (GTEx), and Human Cell Atlas (HCA).

2.  Genetics of type-2 diabetes (T2D): Individuals of Asian descent have a higher susceptibility to T2D. In particular, Singapore has the highest incidence of T2D among developed countries. We seek to identify the genetic drivers of T2D using a combination of genomic, transcriptomic, proteomic, and metabolomic datasets in a multi-ethnic pan-Asian cohort with thousands of participants.

3. Machine learning for single-cell and spatial transcriptomics: Our group applies deep learning and Bayesian models to tasks such as cell segmentation and 3D reconstruction of sparse spatial transcriptomic datasets. Our group is especially interested in spatial barcoding technology with subcellular resolution and has active collaborations with leading spatial transcriptomic technology providers.

3、招生简介

2023年拟招1名Computational Postdoctoral Research Fellow以及1名Wetlab Postdoctoral Research Fellow。

Computational职位要求如下:

•  获得基因组学生物信息/计算生物学统计学数据科学计算机,电子工程等学科的博士学位

•  有一篇(或以上)第一作者文章

•  Unix,R,Python 语言的编程经验,掌握基本的统计学以及机器学习知识

•  高性能计算机群或云计算使用经验

•  积极主动,坚持不懈,谦逊好学

•  有功能基因组学(RNA-seq,ATAC-seq,eQTL)经验的申请者优先考虑

Wetlab职位要求如下:

• 获得分子生物学生物化学细胞生物学或相关领域的博士学位,或具有等同的经验

• 在分子生物学方面有丰富的经验(小鼠实验经验是加分项),并通过在相关科学期刊上发表的第一作者论文

• 出色的沟通和团队协作技能

• 有能力独立设计和排除实验故障

实验室将会提供:

• 世界最大的亚洲人多组学单细胞数据集

• 一流的高性能计算环境(CPU+GPU)以及测序设备

• 自由宽松的学术环境,实验室会全力支持组员的学术兴趣

• 每周一次的个性化指导,为你在学术界或者工业界工作做好准备

• 薪资与世界一流大学持平,包括医疗保险,养老金等福利

4、申请方式

申请为rolling basis,先到先得。录取后可以快速开展研究工作(申请签证可能要2个多月时间)。符合条件的申请人请邮件联系。来信时请附上以下材料:

1)CV (请注明代表作)

2)Contact information for 3 references

3) A cover letter to describe your current and future research interest

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