国家自然科学基金作为我国支持基础研究的主渠道之一，面向全国，重点资助具有良好研究条件、研究实力的高等院校和科研机构中的研究人员，逐渐形成和发展了由研究项目、人才项目和环境条件项目三大系列组成的资助格局。按照资助类别可分为面上项目、重点项目、重大项目、重大研究计划、国家杰出青年科学基金、海外、港澳青年学者合作研究基金、创新研究群体科学基金、国家基础科学人才培养基金、专项项目、联合资助基金项目以及国际（地区）合作与交流项目等。
国家社科基金设有马克思主义·科学社会主义、党史·党建、哲学、理论经济、应用经济学等23个学科规划评审小组以及教育学、艺术学、军事学三个单列学科，已形成包括重大项目、年度项目、特别委托项目、后期资助项目、西部项目、中华学术外译项目等六个类别的立项资助体系。
中国博士后科学基金包括面上资助两批次、特别资助、优秀学术专著出版资助。面上资助是给予博士后研究人员在站期间从事自主创新研究的科研启动或补充经费。特别资助（站前）目的是为吸引新近毕业的国内外优秀博士进站，特别资助（站中）目的是为激励在站博士后研究人员增强创新能力。优秀学术专著出版资助用于资助博士后研究人员出版在站期间所取得的研究成果。
国家自然科学基金外国学者研究基金项目旨在支持自愿来华开展研究工作的外国优秀科研人员，在国家自然科学基金资助范围内自主选题，在中国内地开展基础研究工作，促进外国学者与中国学者之间开展长期、稳定的学术合作与交流。
上海市自然科学基金项目包括包括面上项目与原创探索项目两类，面上项目支持基础研究和应用基础研究，鼓励自由探索。原创探索项目鼓励开展风险性强、原创性强的基础研究工作。
北京市自然科学基金设立研究项目基金、对外合作交流基金、专著出版基金、会长基金，形成了具有特色的资助体系。基金资助方向为应用基础研究、高新技术的技术基础研究和部分基础研究，重点资助促进首都经济社会发展的应用基础研究。基金资助对象为北京地区科研院所、高等院校、有条件的企事业单位中从事自然科学基础研究的科研人员。
山东省自然基金是省级科技计划体系的重要组成部分，资助支持开展基础研究、应用基础研究和科学前沿探索，实现前沿引领技术、关键共性技术、现代工程技术、颠覆性技术创新，为加快全省经济社会高质量发展夯实科学技术基础支撑。
广东省自然科学基金面向全省，主要资助我省经济、社会发展的应用基础研究，同时资助部分自然科学基础研究和基础性工作。
为深入实施创新驱动发展战略，进一步提升创新型省份建设水平，支持以培育原始创新源，培养青年科技人才和加强技术储备为主要目标的应用基础研究，为江苏省经济和社会持续发展提供人才支撑和源头引领，省财政设立省基础研究（省自然科学基金）专项资金。
浙江省自然科学基金面向全省，主要资助自然科学、工程科学和管理科学等领域中的基础研究、应用基础研究以及战略性前沿技术研究。凡有能力、有条件从事基础研究的我省科研人员均可按相关管理规定申请资助。浙江省自然科学基金注重基础研究、自由探索、青年人才培养和国内外合作交流，形成了由研究类项目、人才类项目和学术交流类项目三大系列组成的资助体系。
