2023年10月，国家人力资源和社会保障部、全国博士后管理委员会批准新设立了全国510个博士后科研流动站。其中，上海交大获批新增设7个一级学科博士后科研流动站，分别为海洋科学、航空宇航科学与技术、教育学、设计学、食品科学与工程、公共卫生与预防医学、护理学。学校博士后科研流动站总数已达45个。

上海交大于1985年建立博士后科研流动站，是首批设站、招收培养博士后的单位之一。目前，上海交大博士后科研流动站设站增至45个，覆盖全校绝大多数一级学科博士学位授权点。目前全校在站博士后规模（含医学院）达2400余人。